MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017810	TAA	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017810	CTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017810	AG	4	8	1098	1105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017810	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017810	TAT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017810	T	7	7	1213	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017810	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017810	AG	3	6	1257	1262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017810	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017810	CAG	3	9	1290	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017810	CCT	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017810	T	6	6	2270	2275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017810	CTTTT	2	10	2280	2289	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017810	CA	4	8	2297	2304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017810	A	6	6	2304	2309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017810	CAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017810	TGAA	2	8	2348	2355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017810	ATTTT	2	10	2365	2374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017810	AT	3	6	2470	2475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017810	AT	3	6	2477	2482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017810	ATG	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017810	CA	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017810	GTAA	2	8	2546	2553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017810	T	8	8	2566	2573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017810	TCTT	2	8	2583	2590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017810	A	6	6	2591	2596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017810	AT	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017810	AAC	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017810	TAAA	2	8	2682	2689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017810	ATTT	2	8	2710	2717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017810	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017810	ATTT	2	8	2742	2749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017810	AGT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017810	TAG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017810	ATTT	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017810	AGC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017810	GCA	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017810	CAG	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017810	ATTC	2	8	3663	3670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017810	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017810	CT	3	6	3715	3720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017810	TCT	3	9	3718	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017810	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017810	CAT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017810	CAC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017810	AAT	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017810	CT	3	6	3800	3805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017810	T	7	7	3829	3835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017810	T	8	8	3858	3865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017810	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017810	A	6	6	3901	3906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017810	ATGA	2	8	3938	3945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017810	CA	3	6	3953	3958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017810	ATA	2	6	3959	3964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017810	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017810	AAG	2	6	3994	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017810	ATT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017810	TAAT	2	8	4023	4030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017810	ATTAT	2	10	4035	4044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017810	TATT	2	8	4056	4063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.